公開(公告)號
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CN1884521A
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公開(公告)日
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2006.12.27
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申請(專利)號
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CN200610089339.9
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申請日期
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2006.06.21
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專利名稱
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發(fā)現(xiàn)新基因的方法和使用的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)平臺以及新基因
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主分類號
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C12N15/09(2006.01)I
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分類號
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C12N15/09(2006.01)I;G06F19/00(2006.01)I;C12N15/12(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;A61K48/00(2006.01)I;A61P9/00(2006.01)I;C07K14/435(2006.01)I;A61K38/17(2006.01)I;G01N33/68(2006.01)I
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分案原申請?zhí)? |
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優(yōu)先權(quán)
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申請(專利權(quán))人
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北京未名福源基因藥物研究中心有限公司;天津溥瀛生物技術(shù)有限公司;美國福源集團(tuán)
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發(fā)明(設(shè)計(jì))人
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于在林;鄭志華;唐元華;富 巖
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地址
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100085北京市海淀區(qū)上地39號北大生物城
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頒證日
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國際申請
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進(jìn)入國家日期
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專利代理機(jī)構(gòu)
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北京三友知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司
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代理人
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丁香蘭;趙曉梅
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國省代碼
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北京;11
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主權(quán)項(xiàng)
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一種發(fā)現(xiàn)新基因的方法,該方法包括以下步驟: 1)從已公開發(fā)表的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫中獲取長度小于300AA或400AA或500AA,首選的是300AA、優(yōu)選的是400AA、更優(yōu)選的是500AA的所有蛋白質(zhì)序列,并將這些序列轉(zhuǎn)為統(tǒng)一格式; 2)對上述蛋白質(zhì)序列進(jìn)行批量跨膜區(qū)域分析從中排除含有跨膜區(qū)域的所有序列; 3)對保留的序列批量進(jìn)行分泌型信號肽分析; 4)將獲取的序列片段作為模型對表達(dá)序列標(biāo)簽文庫作比對,獲得具有一定匹配的表達(dá)序列標(biāo)簽; 5)對表達(dá)序列標(biāo)簽進(jìn)行拼接;和 6)與已知數(shù)據(jù)庫的序列進(jìn)行比較,獲得新的全長基因。
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摘要
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本發(fā)明涉及一個(gè)利用生物信息學(xué)分析,計(jì)算機(jī)模擬預(yù)測技術(shù)和分子生物學(xué)技術(shù)來發(fā)現(xiàn)新基因的計(jì)算機(jī)分析系統(tǒng)平臺。特別是本發(fā)明利用已知的人類基因組序列資料,通過自編程序和分析途經(jīng),獲得了一種便捷和有效的計(jì)算機(jī)分析和預(yù)測手段,發(fā)現(xiàn)和制備了一系列的具有生物學(xué)功能的新基因。本發(fā)明同時(shí)還公開了兩個(gè)新發(fā)現(xiàn)的類似于人載脂蛋白A1BP的基因,命名為:BFC06016和BFC06104,它們在GenBank的登錄號分別為:DQ778079和DQ778080。這兩個(gè)基因及所編碼的蛋白質(zhì)可能與膽固醇在體內(nèi)代謝相關(guān),可作為人類心血管疾病診斷與治療的候選藥靶基因或作為基因藥物而具有臨床應(yīng)用意義。
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國際公布
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