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H5、H7、H9亞型禽流感病毒的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法

公開(kāi)(公告)號(hào) CN1814805A  
公開(kāi)(公告)日 2006.08.09  
申請(qǐng)(專利)號(hào) CN200510110990.5  
申請(qǐng)日期 2005.12.01  
專利名稱 H5、H7、H9亞型禽流感病毒的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法  
主分類號(hào) C12Q1/68(2006.01)I  
分類號(hào) C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專利權(quán))人 上海交通大學(xué)  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 張大兵;楊立;熊靜靜;潘愛(ài)虎;尹長(zhǎng)松  
地址 200240上海市閔行區(qū)東川路800號(hào)  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專利代理機(jī)構(gòu) 上海交達(dá)專利事務(wù)所  
代理人 王錫麟;王桂忠  
國(guó)省代碼 上海;31  
主權(quán)項(xiàng) 一種H5、H7、H9亞型禽流感病毒的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法,其特征在于,包括如下步驟: (1)標(biāo)準(zhǔn)分子的構(gòu)建,在基因庫(kù)中檢索獲得禽流感病毒的保守基因,M基因以及H5、H7、H9亞型特異性基因,HA基因的序列,通過(guò)網(wǎng)上序列比對(duì),確定禽流感病毒共有基因M以及H5、H7、H9亞型特異性基因HA的高度保守序列區(qū),根據(jù)確定的保守序列區(qū)設(shè)計(jì)引物,利用基因克隆技術(shù)構(gòu)建同時(shí)含有禽流感病毒共有基因M以及H5、H7、H9亞型特異性基因HA的高度保守序列區(qū)的標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒分子; (2)病毒特異性定量PCR引物和探針設(shè)計(jì); (3)病毒樣本RNA的提。 (4)對(duì)提取的樣本RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)得到樣本cDNA; (5)M基因定量PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化和建立,通過(guò)100-1000nM范圍內(nèi)各個(gè)濃度的引物和探針的組合,尋找所要求的反應(yīng)效率和曲線的反應(yīng)體系; (6)禽流感病毒亞型特異性定量PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化和建立,通過(guò)100-1000nM范圍內(nèi)各個(gè)濃度的引物和探針的組合,尋找所要求的反應(yīng)效率和曲線的反應(yīng)體系。  
摘要 一種H5、H7、H9亞型禽流感病毒的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法,屬于生物工程技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明包括如下步驟:標(biāo)準(zhǔn)分子的構(gòu)建;病毒特異性定量PCR引物和探針設(shè)計(jì);病毒樣本RNA的提取;對(duì)提取的樣本RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)得到樣本cDNA;M基因定量PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化和建立;禽流感病毒亞型特異性定量PCR檢測(cè)方法的優(yōu)化和建立。本發(fā)明檢測(cè)靈敏度達(dá)到20個(gè)拷貝的病毒分子,對(duì)于單個(gè)樣本檢測(cè)時(shí)間為2個(gè)小時(shí),操作簡(jiǎn)便,并且可以同時(shí)進(jìn)行大批量的樣本分析,較傳統(tǒng)的利用雞胚進(jìn)行病毒分離培養(yǎng)的方法在靈敏度利檢測(cè)時(shí)間方面有了極大的提高,對(duì)于禽流感病毒的監(jiān)控、鑒定具有很大的幫助和很高的應(yīng)用前景。  
國(guó)際公布  
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