載脂蛋白分離純化后,獲得了所需要的純品,該純品純度及其品種可通過下述方法進行鑒定。
一、免疫電泳法
免疫電泳法既可用于鑒定蛋白種類,又可鑒定其純度。
制備1%的瓊脂糖,以0.1mmol/L巴比妥緩沖液(0.05μ,pH8.6)為溶劑,制作一塊約7×4cm的大小,厚度為0.2~0.3cm的瓊脂糖凝膠,以玻璃板或薄膜為支持物,于凝膠正中打孔(直徑0.2cm)。1孔加全血清5μl,2孔(中間孔)加純化的某產品,3孔加已知某載脂蛋白。電泳電極液為0.05μ,pH8.6的巴比妥緩沖液。當標本前沿泳動到距離凝膠端1cm左右,停止電泳,取出凝膠板,在凝膠板三孔之間開兩條寬0.2cm,長5~5.5cm長的凝膠槽。1與2孔之間的凝膠槽(A槽)中加入羊抗人全血清抗體,2與3孔之間的凝膠槽(B槽)加入羊抗人某Apo單價特異抗血清,將凝膠板置于含少量水的大平皿中,加蓋,水平置于37℃培養(yǎng)箱24h,再觀察弧形白色沉淀線,與A槽沉淀線位置比較若位置完全相同,初步可以確認為2孔純化產品與3孔標準蛋白是同一蛋白質,如圖17-7所示。
圖17-7 免疫電泳圖(瓊脂糖凝膠)
A:1、2、3分別為抗人ApoAⅠ血清(第一化學)、抗人全血清,抗人ApoAⅠ血清(自制);a、b、c、d分別為ApoAⅠ純品(純化產品)、人血清、人血清、ApoAⅠ純品(sigma)
B:1、2分別為抗人全血清,抗有ApoB血清(自制):a、b、c分別為人血清、人血清和人ApoB純品(自制)
二、免疫火箭電泳
按本章節(jié)的方法進行操作,若為單一火箭沉淀峰,也可判純化產品為單一蛋白,如圖17-8所示。
三、免疫雙擴散法
制備1%瓊脂糖凝膠(0.05μ,pH8.6的巴比妥緩沖液為溶劑),按圖打孔。圖17-9中孔加入已知某Apo單價特異羊抗人血清,周邊第1孔加純化產品,第2孔加已知某Apo純品,置37℃培養(yǎng)箱24h,若第1與2孔旁兩條白色沉淀線相互融成一個弧形,無分叉,表明1孔與2孔的蛋白質與中孔抗血清的抗有相同的抗原性,可確認為同一蛋白質。
17-8 免疫火箭電泳圖
A:瓊脂糖凝膠板含抗人全血清、抗原孔含人ApoAⅠ純品;
B:瓊脂糖凝膠析含抗人全血清、抗原孔含人ApoB純品。
圖17-9 各種抗原抗體系的沉降線示意圖
1,2:同一抗原抗體系(complete identity)
3m.quanxiangyun.cn/zhuyuan/:不同的抗原抗體系(nonientity)
4:部分相同的抗原抗體系(partialidentity)
四、等電聚焦電泳
利用IEF-PAGE測等電點,根據(jù)等電點確認蛋白質性質。
五、蛋白質分子量測定
從化學觀點考慮,分子量是組成蛋白質分子的各原子量總和。但是,對大分子的蛋白質來講,若不知道分子量也無法得知每個分子的元素組成情況。為此,人們在蛋白質的研究中,對測定其分子量工作極為重視,先后用于測定蛋白質分子量的方法有滲透壓、粘度、光散射、蛋白質氨基酸序列分析法、超速離心(沉降速度或沉降平衡)、凝膠層析和SDS-PAGE等法。載脂蛋白分子量測定多采用超速離心沉降速度法、凝膠層析法和SDS-PAGE法。
凝膠法層析用:1gM=A-B(Ve/Vo)
SDS-PAGE用:lgM=A-BRf
式中,對已知標準樣品,x和y分別為實驗值和已知值。n是實驗的點數(shù)。采用上述兩個方程,由已知樣品的數(shù)據(jù),可以求出標準線的兩個常數(shù)A、B值。對未知樣品,只要測出x,利用A、B值可以計算出y值?傊,從實驗測得的數(shù)據(jù)計算該實驗方法所用方程的常數(shù),再用這個常數(shù)計算出未知樣品的分子量,所得結果比作圖法精確,且很方便。
下文僅介紹SDS-PAGE作圖法測定蛋白質的分子量。
十二烷基磺酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)是一種陰離子去污劑,于100℃加熱,在β-巰基乙醇存在下,可以使大多數(shù)多聚體蛋白質的四級結構解體,并與各亞基牢固地結合,從而遮蔽了蛋白質分子上原有電荷,同時帶上強的負電荷。
由于所有的SDS-蛋白質復合物(圖17-10),在電泳時都以同樣的電荷按分子量大小不同向正極移動,作SDS聚丙烯酰胺凝膠泳動(SDS-PAGE)時,其泳動速度僅決定于蛋白質的分子量。SDS與蛋白質的結合是成比例的,所以SDS-蛋白質復合物在泳動中的不同速率,就反映了分子量的不同。與分子量的對數(shù)和相對遷移率成一定比例關系。使用已知分子量的標準物作標準曲線(圖17-11,圖17-12)或用計算法確定標準曲線的常數(shù),即可求出未知樣品的分子量。用這種方法測定的分子量是亞單位肽鏈的分子量。
圖17-10 SDS對蛋白質四級結構的破壞作用,SDS與亞基牢固地結合,遮蔽了蛋白分子的原有電荷
實驗結果也可以通過公式運算求蛋白質分子量:
先求得遷移率Rf,Rf=de/do
de為樣品遷移距離,do為前沿遷移距離(染料)
從幾種標準樣品的Rf值和分子量對數(shù),用最小二乘法能準確地求得a、b二常數(shù),從而可進行未知物分子量的計算。
圖17-11 人ApoAⅠ分子量測定圖(SDS-PAGE)
圖17-12標準蛋白質分子量測曲線(SDS-PAGE)
1為蛋白質標準分子量(LKB):
2為ApoAⅠ純品(Sigma);
3為ApoAⅠ純品(自制)
SDS-PAGE的分子量測定簡要步驟是:①制備4%~30%的聚丙烯酰胺梯度凝膠;②待測蛋白純品和標準分子量標本的制備,按蛋白樣品1mg/ml濃度溶于含有20%蔗糖的電極緩沖液中,加入5μl0.1%溴酚蘭作指示染料,取50μl上樣;③電泳:電極緩沖液(有多種),含1%SDS;④染色脫色:考馬斯亮蘭R-25m.quanxiangyun.cn/job/0染色,脫色;⑤制作標準分子量曲線;量取從原點到前沿溴酚蘭及原點至各條蛋白區(qū)域的距離。計算各自標準蛋白的Rf值,以LogMW對相應的Rf作圖,繪成標準分子量蛋白曲線如圖17-8、圖17-9所示,以待測蛋白質的Rf值在標準曲線上得到LgMW值,計算待測Apo純品的分子量。
測定分子量的SDS-PAGE法主要優(yōu)點是快速,樣品用量少,可同時測定幾個樣品。缺點是誤差較大,誤差主要與電泳蛋白區(qū)域移動距離測量是否有關。
SDS-PAGE法測定的是亞單位肽鏈的分子量。常用的標準蛋白質如表17-1所示。
表17-1 標準蛋白質及其分子量
名 稱 | 分 子 量 | 名 稱 | 分 子 量 |
細胞色素C | 11700 | 過氧化氫酶(單體) | 60000 |
核糖核酸酶 | 13700 | 牛血清白蛋白(單體) | 68000 |
肌紅蛋白 | 17200 | 乳酸脫氫酶(單體) | 36000 |
胰凝乳蛋白酶原 | 25700 | 乳酸脫氫酶 | 130000 |
胰蛋白酶 | 23300 | β-淀粉酶 | 215000 |
羧肽酶A | 34600 | 過氧化氫酶 | 240000 |
胃蛋白酶 | 35000 | 黃嘌呤氧化酶 | 275000 |
卵清白蛋白 | 45000 | 脲酶 | 483000 |
六、雙相電泳
血漿或組織中有成千累萬種蛋白質,等電點近似,分子量大小類同的蛋白質很多,若僅單一測蛋白質的pI或分子量,還不足以說明是某一的蛋白質,可能是也可能不是。如果既測定pI,又測定分子量,利用這兩種參數(shù)鑒定蛋白,其確認的準確率將得到很大的提高,因為這兩種參數(shù)都相同的蛋白質的概率是很小的。為此常采用雙相電泳技術即第一相為IEF-PAGE,另一相為SDS-PAEG,進行蛋白質的鑒定。
七、蛋白質化學組成分析
末端氨基的分析,是鑒定蛋白質純度的方法之一。一條肽鏈的蛋白質,通過N-末端的定量分析,每克分子蛋白質應當有整數(shù)克分子的N-末端氨基酸,少量其他末端氨基酸的存在,常常表示存在有雜質。
分析蛋白質各種氨基酸百分比,也可作為蛋白質各類鑒定的參考值。
最終的純度標準,應當是氨基酸順序的測定。