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曲霉病的病原菌為曲霉屬的一些種。中國(guó)真菌志第5卷列有我國(guó)曲霉屬14個(gè)組的89個(gè)種和變種，其中部分為病原菌。煙曲霉是最常見的病原菌，可引起所有的過敏性和感染性曲霉病。
僅有無性期的曲霉屬半知菌亞門-絲孢菌綱-絲孢菌目-叢梗孢科。有些種具有性期，屬子囊菌亞門-不整子囊菌綱-散囊菌目-散囊菌科，主要為散囊菌屬、新薩托菌屬、裸殼孢屬和石座菌屬等。具有性期的曲霉能產(chǎn)生閉囊殼，為封閉式的薄壁子囊果，內(nèi)含子囊和子囊孢子。
曲霉屬具有特征性的結(jié)構(gòu)，為分生孢子頭和足細(xì)胞（稱分生孢子梗)，分生孢子頭包括分生孢梗、頂囊、瓶梗、梗基和分生孢子鏈。頂囊為分生孢子梗頂部的可孕性膨大。表面只有瓶梗稱單層小梗，為產(chǎn)孢細(xì)胞。
同時(shí)有瓶梗和梗基稱雙層小梗。有些種則既有單層，也有雙層，甚至同一頂囊上兩者兼而有之。足細(xì)胞為特化的厚壁膨大的菌絲細(xì)胞。一側(cè)垂直向上延長(zhǎng)形成分生孢子孢梗莖，簡(jiǎn)稱孢梗莖。
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