。ㄒ)相關(guān)分析常用參數(shù)
在估計某一基因座位與疾病相關(guān)時,有幾個常用術(shù)語,如相對危險率與歸因危險、于此略予介紹。
1.RR相對危險度的計算
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抗 原 |
|
+ - | ||
疾病+ - |
a b c d |
a+b c+d |
總數(shù) |
a+c b+d |
a+b+c+d=n |
a和b分別代表患有某種疾病已檢出和未檢出某種抗原的人數(shù);c和d分別代表正常對照(末患該病)檢出某種抗原和末檢出某種抗原的人數(shù);n為調(diào)查總數(shù),表示樣本的大小。然后按X公式計算:
X2=(│a·d-│b·c│-n/2)2·n/(a+c)·(b+d)·(a+b)·(c+d)
根據(jù)所得的X2值然后從X2表中求出P值。若P<0.05則認(rèn)為是差異顯著。
如果抗原與疾病有關(guān),則進(jìn)一步計算它們關(guān)聯(lián)的程度。通常用相對危險度(relative risk)RR值來表示,RR值越大表示相關(guān)程度越大。
RR=α·d/b·c
另一種RR(relative risk)值計算公式是:
RR=Fp(1-Fc)/Fc(1-Fp)
Fp為病人抗原頻率,F(xiàn)c為該地區(qū)正常對照人群中的抗原頻率RR值表示某一特定HLA抗原和疾病之間的相關(guān)強(qiáng)度,即具有該HLA抗原的個體較缺乏這一抗原的個體易產(chǎn)生這種疾病的可能性。
RR=1時,無區(qū)別
RR>4時,相關(guān)較為肯定
RR<1時,表明有抵抗基因,是一種保護(hù)而不是易感
2.歸因危險 另一個公式稱歸因危險(attributable risk),又叫病因系數(shù)(etiologic factor),表示群體中病人組中有百分之多少歸因于HLA:
歸因危險=B(R-1)/[B(R-1)+1]
B為患者人群的百分率;R為相對危險率。如強(qiáng)直性脊椎炎的歸因危險為0.89即患該病人群中有89%是與HLA-B27抗原相關(guān)。