D因子是啟動替代途徑激活的重要成分,為由222個氨基酸殘基組成的單鏈絲氨酸蛋白酶,分子量僅25kDa。D因子在血清中的濃度很低(1-2μg/ml),主要以活化形式而存在。但可能還有一種以酶原形式而存在的由239個氨基酸殘基組成的D因子。具有活性的D因子(D)可能在第234-235位的精氨酸-賴氨酸鍵處將B因子裂解為Ba和Bb兩個片段,從而啟動替代途徑的級聯(lián)活化反應(yīng)。D因子的部分cDNA已克隆成功,并進(jìn)行了序列分析,發(fā)現(xiàn)其與其它幾種絲氨酸蛋白酶(如胰蛋白酶、糜蛋白酶、纖溶酶及弱性蛋白酶)具有同源性。