按人體的系統(tǒng)或解剖部位建立的學科有口腔科學、皮膚性病學、眼科學、神經病學、耳鼻喉科學、內分泌學等等。
口腔科（國外稱為齒科)很早就是獨立的學科，并有其相應的教育和醫(yī)療研究機構，至今國外統(tǒng)計醫(yī)務人員時，仍常將口腔科醫(yī)生單獨列出。其他學科多系內、外科學的分支學科。這些學科研究的疾病都以一定的部位或系統(tǒng)為主，工作和研究中往往需要較特殊的檢查治療技術與設備，于是逐漸形成了獨立的學科。其中皮膚病與性病放在一起，這是因為性病多通過皮膚粘膜傳染，且在病程中均會出現(xiàn)一定的皮膚粘膜損害之故。我國由于性病已基本控制，一般醫(yī)院只設皮膚科。
內分泌學有狹義與廣義之分。狹義的內分泌學，又稱傳統(tǒng)的內分泌學，是指一些分泌激素的無管腺體（ductless glands)的疾病，如甲狀腺、甲狀旁腺、性腺、腎上腺、胰島等。這些腺體大多接受腦垂體分泌的促激素調節(jié)。晚近的研究表明人體各系統(tǒng)之間與其內部的各個器官，除通過神經組織互相調節(jié)以外，還通過體液因素（遞質)而互相聯(lián)系，配合默契。廣義的內分泌學把這些通過體液因素發(fā)生聯(lián)系的功能都包括進去，因此出現(xiàn)了神經內分泌、消化道激素、肺的非呼吸功能，甚至腫瘤的內分泌行為等新的研究領域。這些新的研究領域的出現(xiàn)，自然是醫(yī)學對人體認識深入的表現(xiàn)，但在收治病人時通常仍以傳統(tǒng)的內分泌學內容為準。
按照解剖部位設立學科，可使研究的目標更為集中，自然有利于這些專業(yè)的發(fā)展。不僅現(xiàn)代醫(yī)學中有這種學科，我國傳統(tǒng)醫(yī)學中也有正骨、喉科、痔漏等�？�。我國浴室中的修腳其實也是一種�？�，對于腳部的雞眼、胼胝、灰甲等病也積累了不少診斷治療的經驗，曾得到外國芭蕾舞演員的贊賞。如果用現(xiàn)代科學加以整理、提高，或許能形成我國特有的“腳病學”而為世界做出貢獻。
這類學科在研究與應用中特別要注意整體觀念，因為局部的病變往往是全身疾病的表現(xiàn)。只見局部而忽略整體，就會出現(xiàn)認識和處理上的差錯。
這類學科還在不斷發(fā)展中。內科與外科的一些內容，還在不斷地按照人體的解剖生理系統(tǒng)形成專門化的分支學科，如血液病學、骨科學、泌尿學、神經外科學、麻醉與止痛等等；有的已有專門的學會、學術刊物與研究機構。近年來，國外還把內科消化系統(tǒng)與腹部外科以及病理、放射診斷的力量組織在一起，建立新的消化系�？疲òㄎ�、腸、肝、膽、胰的疾患)。國內也有此類專門的研究機構，如心血管疾病研究所。
